Über die Schaltfläche Extras -> Duels kann man Mitspieler zu einem Duell auffordern. Wenn dieser akzeptiert hat, wird eines von fünf verschiedenen Proteinen zufällig ausgewählt. Es kann gleichzeitig oder zeitversetzt gespielt werden. Der Sieger bekommt 4 Award-Punkte, die er für Oracles oder Peekaboos einsetzen kann. Dem Verlierer werden keine Punkte abgezogen.
Bei einem Duell hat jeder nur 20 Züge und es gibt kein Restore Best.
Liste der Duell-Puzzle und Vergleich der Scores bei verschiedenen Startsequenzen