Foldit
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Änderungen: CASP

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| [http://fold.it/portal/node/988118 R9] || [http://predictioncenter.org/casp9/target.cgi?id=190&view=refinement TR622] || [http://www.rcsb.org/pdb/explore/explore.do?pdbId=3nkl 3nkl] || p style="text-align:right"|11122 || Contenders || p style="text-align:right"|11120 || [http://fold.it/portal/user/108474 Bletchley Park] || Contenders || [[CASP#TR622|3, Grom, Russian team]]
 
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==== [[TR622]] ====
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GDT-TS/GDT-HA des Startmodells: 67.42/49.38<br>
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''GDT-TS/GDT-HA of the starting model: 67.42/49.38''
   
 
== CASP9-last-Puzzles ==
  
== CASP9-last-Puzzles ==

Version vom 27. August 2011, 16:08 Uhr

"CASP (Critical Assessment of Techniques for Protein Structure Prediction; dt.: kritische Überprüfung von Techniken zur Vorhersage von Proteinstrukturen) ist ein seit 1994 zweijährig stattfindendes Gemeinschaftsexperiment (häufig auch als Wettbewerb bezeichnet),[...].

CASP bietet Forschergruppen die Möglichkeit, die Qualität ihrer Methoden zur Vorhersage von Proteinstrukturen ausgehend von der Primärstruktur zu testen und sich einen Überblick über den aktuellen Stand auf diesem Forschungsgebiet zu verschaffen.

Dazu werden noch nicht veröffentlichte Proteinstrukturen als Vorgabe für die Berechnungen verwendet und die Ergebnisse der Berechnungen dann mit experimentellen Laborergebnissen verglichen."
(Auszug aus dem deutschen Wikipedia-Artikel)


Mini-CASP

Bei Mini-CASP-Puzzlen wird die Tertiärstruktur, die während der Laufzeit der einzelnen Puzzle noch unbekannt ist, schon kurz nach Beendigung bekanntgegeben. Sie haben mit dem CASP-Wettbewerb nichts zu tun, werden aber vom Foldit-Team und den Spielern dazu genutzt, sich auf ihn vorzubereiten.


CASP8

Foldit war das erste Mal (allerdings nur als Teil des BakerLab-Teams) beim achten Wettbewerb (CASP8) vertreten, welcher 2008 stattfand. Zur Vorbereitung wurden von den Spielern alte CASP7-Proteine gefaltet und die Ergebnisse von den Entwicklern mit den veröffentlichten Strukturen verglichen.

Einige Tage nach dem Start von CASP8[1] wurde gerade einmal die erste offene Betaversion von Foldit veröffentlicht.[2] Die Spieler und Entwickler haben dann einen Monat lang trainiert und das Programm weiterentwickelt, bevor sie sich an ihrem ersten CASP8-Puzzle versuchten.[3] Aufgrund dessen haben sie sich auch nur an relativ wenigen Targets des Wettbewerbs beteiligt. Trotz dieser Handicaps waren einige Plätze in den Top 3 und sogar ein Sieg die sehr guten Ergebnisse. Insgesamt waren die Foldit-Spieler genauso gut wie die Experten mit all ihren Werkzeugen und besser als alle vollautomatischen Computereinsendungen.[4]


CASP9

CASP9 fand vom 3. Mai bis zum 20. August 2010 statt, Ergebnisse werden im November/Dezember 2010 bekanntgegeben.[5]
Beim CASP9 trat Foldit erstmals als eigenständiges Team auf.[6]
Jedes Team (in diesem Fall ist das Foldit-Team als Ganzes gemeint, nicht die einzelnen Gruppen innerhalb von Foldit) konnte pro Target bis zu 5 verschiedene Vorhersagen abgeben.[7] Das Foldit-Team hat auf jeden Fall die Vorhersage mit dem höchsten Score eingesandt. Es war angedacht, die vier weiteren Einsendungen von den Spielern mittels Solution Voting Puzzles aus mehreren hoch punktenden Vorhersagen auswählen zu lassen.[8] Dies wurde jedoch verworfen.

CASP9-Puzzles

Nr. Target PDB Bester
Score 		Team Bester
Solo-
score 		Spieler
(Player) 		vom Team Bestes Modell,
Spieler,
Team
1a T0520 3mr7 12425 Contenders 12425 Mark- Contenders 1, Mark-, Cont.
1b T0520 3mr7 12273 AD* 12218 aap RDF 2, aap, RDF
1c T0520 3mr7 12047 Void Crushers 12038 Madde Void Crushers 5, Madde, VC
2a T0523 3mqo 10848 RDF* 10848 aap RDF 2, Mark-, Cont.
2b T0523 3mqo 10742 Contenders 10742 Mark- Contenders 5, Mark-, Cont.
2c T0523 3mqo 10777 RDF 10777 aap RDF 3, aap, RDF
2d T0523 3mqo 10943 RDF 10943 aap RDF 4, HillObserver, VC
3a T0527 3mr0 11794 Contenders 11760 steveB Void Crushers 1, CFC, Cont.
3b T0527 3mr0 11615 RDF 11615 aap RDF 5, aap, RDF
4 T0525 3mqz 12639 RDF 12639 aap RDF 2, Mark-, Cont.
5 T0538 2l09 9449 Contenders 9449 Mark- Contenders 3, Tessa, AD
6 T0540 3mx7 10068 AD 9973 vertex RDF 2, Contenders
7 T0544 2l3w 11239 Contenders 11197 mimi Contenders 3, aap, RDF
8 T0553 2ky4 11367 Contenders 11345 HillObserver Void Crushers 5, Russian team
9 T0564 2l0c 10266 Contenders 10266 CFC* Contenders 5, cadeh_cam111
10 T0556 - 9691 Contenders 9681 CFC Contenders canceled
11 T0566 3n72 11634 RDF 11634 aap RDF 5, AD
12 T0568 3n6y 11723 SETI.Germany 11723 Susanne SETI.Germany 1, Susanne, SETI.G
13 T0569 2kyw 9798 Free-DC 9770 Cartoon Villain - 1, philcalhoun, Free-DC
14 T0561 2xse 11692 Contenders 11692 CFC Contenders 2, Tlaloc, Mojo Risin'
15 T0576 3na2 11283 RDF 11283 aap RDF 2, AD
16 T0578 3nat 11839 Contenders 11839 CFC Contenders 2, mat747, VC
17 T0579 2ky9 11194 Void Crushers 11194 Madde Void Crushers 1, Madde, VC
18 T0580 3nbm 10681 Contenders 10681 Mark- Contenders 2, Krog, AD
19 T0586 3neu 9910 RDF 9903 Mark- Contenders 2, Mark-, Cont.
20 T0590 2kzw 11386 RDF 11386 aap RDF 2, Mark-, Cont.
21 T0592 3nhv 11232 RDF 11232 aap RDF 1, aap, RDF
22 T0594 3ni8 11422 RDF 11422 aap RDF 4, Krog, AD
23 T0581 3npd 10753 Void Crushers 10749 Madde Void Crushers 1, Madde, VC
24 T0598 3njc 11529 Contenders 11528 Mark- Contenders 1, Mark-, Cont.
25 T0600 3nja 11338 Void Crushers 11336 Madde Void Crushers 3, Mark-, Cont.
26 T0610 3ot2 12306 Contenders 12306 Mark- Contenders 1, Mark-, Cont.
27 T0612 3o0l 10710 Russian team 10634 xiando Oma Gawd 2, mat747, VC
28 T0614 10943 Contenders 10943 Mark- Contenders 1, Mark-, Cont.
29 T0616 3nrt 10070 Contenders 10070 Mark- Contenders 2, Susanne, Seti.G
30 T0605 3nmd 10049 - 10049 Marie Suchard - 5, Commaster, Ukraine
31 T0622 3nkl 10247 AD 10247 Pletsch AD 1, Pletsch, AD
32 T0619 3nrw 10394 Contenders 10353 gdnskye RDF 2, gdnskye, RDF
33 T0618 3nrh 10566 AD 10564 cadeh_cam111 - 1, Madde, VC
34 T0624 3nrl 9687 Contenders 9687 CFC Contenders 3, heather-1, -
35 T0562 2kzx 10867 RDF 10867 aap RDF 1, aap, RDF
36 T0630 2kty 10689 Void Crushers 10660 Madde Void Crushers 3, BootsMcGraw, Cont.
37 T0643 3nzl 9508 Void Crushers 9508 steveB Void Crushers 1, steveB, VC


∗) AD = Anthropic Dreams, RDF = Richard Dawkins Foundation, VC = Void Crushers, CFC = CharlieFortsConscience

GDT-Resultate (Standardpuzzles)

Klicken Sie auf die Targetnummern um zu den jeweiligen Einzelartikeln mit Bildern der verschiedenen Modelle zu kommen.
Click on the target numbers to get to the separate articles with pictures of the various models.

T0520

F# W# GDT_TS M Spieler (Players) Team Score Sb# Templates
1 265 74.42 1 Mark- Contenders 12445 s1(a) 1fx4A
2 351 72.69 4 Marie Suchard - 12171 s4(a) 1fx4A
3 439 69.08 5 Madde, Dolichwier VC 12047 e1(c) 1azsB
4 463 67.49 2 aap, keypad5 RDF 12246 e8(b) 1wc1A
5 499 63.73 3 smith92clone, Renton, Crashguard303, dimension9, Datstandin, Pletsch AD 12273 e1(b) 1wc1A

T0523

F# W# GDT_TS M Spieler (Players) Team Score Sb# Templates
1 256 76.35 4 TheGUmmer, HillObserver VC 10766 e10(d) 3lyxA
2 374 69.82 2 mimi, Mark- Contenders 10842 e3(a) 2v1aA
3 468 63.06 5 Mark- Contenders 10742 s1(b) 2pd7A
4 472 62.16 1 aap RDF 10943 s1(d) 3lyxA
5 492 51.80 3 keypad5, aap RDF 10777 e1(c) 1bywA

T0525

F# W# GDT_TS M Spieler (Players) Team Score Sb# Templates
1 74 63.90 2 Mark-, Bletchley Park Contenders 12447 e5 2a8eA
2 243 56.59 5 rmhorton - 12365 s4 2a8eA
3 244 55.85 3 smith92clone, Pletsch, Renton AD 12386 e12 2a8eA
4 258 53.05 4 Dolichwier, HillObserver, TheGUmmer, steveB VC 12456 e2 2a8eA
5 265 41.95 1 aap RDF 12639 s1 2a8eA

T0527

F# W# GDT_TS M Spieler (Players) Team Score Sb# Templates
1 10 79.04 1 CFC, Mark- Contenders 11794 e1(a) 3h9wA
2 147 72.73 3 Renton, jakyl, dimension9, smith92clone, Pletsch, auntdeen AD 11743 e9(a) 3h9wA
3 262 68.18 2 mat747, Dolichwier, steveB VC 11771 e5(a) 3eehA
4 277 67.42 4 Tamison, setiman, maxwell_thethird, gdnskye, keypad5 RDF 11620 e19(a) 3eehA
5 346 61.11 5 aap RDF 11615 s1(b) 2z6dA

T0538

F# W# GDT_TS M Spieler (Players) Team Score Sb# Templates
1 3 92.45 3 Pletsch7, Renton, Pletsch, smith92clone, Tessa AD 9375 e7 2kruA
2 7 90.57 1 Mark- Contenders 9449 s1 2kruA
3 10 89.15 2 Dolichwier, TheGUmmer VC 9420 e4 2kruA
4 11 89.15 5 superbro - 9338 s12 2kruA
5 15 86.32 4 vertex RDF 9357 s10 2kruA

T0540

F# W# GDT_TS M Spieler (Players) Team Score Sb# Templates
1 204 56.94 2 CFC, Mark-, Bletchley Park, infjamc Contenders 10037 e8 2kd2A
2 238 53.61 3 gdnskye, setiman, Tamison, keypad5, vertex RDF 10022 e12 2kd2A
3 260 50.00 1 Ocire, Datstandin, dimension9, Renton, Pletsch AD 10068 e1 2kd2A
4 290 43.89 4 Dolichwier, TheGUmmer, steveB VC 9970 e20 2kd2A
5 347 34.44 5 MellyLam AHAP 9950 s3 2kd2A

T0540

F# W# GDT_TS M Spieler (Players) Team Score Sb# Templates
1 52 34.44 3 gdnskye, setiman, aap RDF 11122 e7 -
2 76 32.96 1 mimi, Mark- Contenders 11239 e1 -
3 212 26.48 4 Ocire, Marktoo, cfcShadow, dimension9 AD 11118 e8 -
4 225 26.11 2 Dolichwier, TheGUmmer VC 11126 e6 -
5 229 26.11 5 vakobo, Grom Russian team 11095 e17 -

T0553

(2 Domains)

F# W# GDT_TS M Spieler (Players) Team Score Sb# Templates
1 179 27.98 5 Grom, vakobo Russian team 11228 e21 -
2 203 27.43 3 setiman, aap RDF 11345 e6 -
3 236 27.05 2 Dolichwier, TheGUmmer, HillObserver VC 11355 e4 -
4 237 26.87 1 mimi, CFC Contenders 11367 e1 -
5 245 26.68 4 Ocire, Pletsch, Renton, Datstandin, auntdeen AD 11344 e7 -

T0556

F# W# GDT M Spieler (Players) Team Score Sb# Templates
- - - 1 CFC, infjamc Contenders 9691 e1 3clcB
- - - 2 Datstandin, Krog AD 9670 e5 3clcB
- - - 3 Dolichwier, mat747 VC 9658 e8 3clcB
- - - 4 thom001 - 9645 s7 3clcB
- - - 5 Brick Free-DC 9643 s8 3clcB

T0561

F# W# GDT_TS M Spieler (Players) Team Score Sb# Templates
1 126 29.64 2 Tlaloc Mojo Risin' 11510 s21 -
2 268 24.50 5 Cartoon Villain - 11568 s6 -
3 284 24.01 1 CFC Contenders 11692 s1 -
4 292 23.84 4 Datstandin, dimension9 AD 11585 e10 -
5 300 23.51 3 Mad_Max, Grom Russian team 11617 e8 -

T0562

F# W# GDT-TS M Spieler (Players) Team Score Sb# Templates
1 155 31.10 1 aap RDF 10867 s1 3lwxA
2 331 26.22 4 cadeh_cam111 - 10516 s5 3lwxA
3 356 25.20 3 mimi, Mark-, Bletchley Park, CFC Contenders 10773 e6 3lwxA
4 410 22.76 5 Datstandin AD 10479 s8 3lwxA
5 437 20.73 2 steveB, Madde VC 10840 e1 3lwxA

T0564

F# W# GDT_TS M Spieler (Players) Team Score Sb# Templates
1 216 43.03 5 cadeh_cam111 - 10191 s7 -
2 237 41.80 4 Dolichwier, steveB VC 10201 e13 -
3 239 41.80 2 auntdeen, Pletsch, Datstandin, Ocire AD 10254 e5 -
4 240 41.39 3 BikeLoup, lou AHAP 10226 e9 -
5 256 40.16 1 CFC Contenders 10266 s1 -

T0566

F# W# GDT_TS M Spieler (Players) Team Score Sb# Templates
1 375 64.86 5 Datstandin, Pletsch, Pletsch7, smith92clone, jakyl AD 11271 e12 1ubvF
2 394 62.59 2 Dolichwier, Madde VC 11513 e4 1ubvH
3 414 60.31 4 mimi, Mark- Contenders 11488 e6 1ubvD
4 425 59.27 3 BikeLoup AHAP 11507 s2 1ubvD
5 442 51.92 1 aap RDF 11634 s1 1ubvF

T0568

F# W# GDT_TS M Spieler (Players) Team Score Sb# Templates
1 65 40.42 1 Susanne SETI.Germany 11723 s1 2pn5A
2 74 39.58 4 cadeh_cam111 - 11596 s5 2pn5A
3 87 39.17 5 Datstandin, Pletsch7, Pletsch AD 11573 e8 2pn5A
4 88 39.17 2 Madde VC 11674 s2 2pn5A
5 92 38.96 3 CFC Contenders 11636 s3 2pn5A

T0569

F# W# GDT_TS M Spieler (Players) Team Score Sb# Templates
1 170 50.00 1 philcalhoun, Brick Free-DC 9798 e1 2kvzA 3i57
2 222 47.76 5 mimi, Mark- Contenders 9741 e7 2kvzA 3i57
3 293 42.63 2 Cartoon Villain - 9770 s1 2kvzA 3i57
4 353 32.69 3 Dolichwier, TheGUmmer, mat747, Madde VC 9758 e3 2kvzA 3i57
5 464 24.68 4 aap RDF 9749 s2 2kvzA 3i57

T0576

F# W# GDT_TS M Spieler (Players) Team Score Sb# Templates
1 269 30.26 2 dimension9, Pletsch7, smith92clone, auntdeen, Marktoo AD 11220 e3 -
2 271 29.32 4 Cartoon Villain - 11184 s2 -
3 272 29.32 5 Susanne SETI.Germany 11179 s3 -
4 273 29.14 3 mimi, CFC, Bletchley Park, Mark-, spvincent, infjamc Contenders 11210 e9 -
5 283 26.69 1 aap RDF 11283 s1 -

T0578

F# W# GDT_TS M Spieler (Players) Team Score Sb# Templates
1 155 21.79 2 mat747 VC 11785 s3 -
2 301 18.92 5 Cartoon Villain - 11725 s8 -
3 307 18.92 1 CFC Contenders 11839 s1 -
4 337 18.24 3 vakobo, Grom Russian team 11781 e4 -
5 348 18.07 4 Pletsch AD 11708 s12 -

T0579

(2 Domains)

F# W# GDT_TS M Spieler (Players) Team Score Sb# Templates
1 18 43.95 1 Madde VC 11194 s1 -
2 37 42.94 4 Grom Russian team 11133 s3 -
3 40 42.74 3 CFC Contenders 11171 s2 -
4 82 40.93 5 smith92clone, Datstandin, Renton AD 11056 e13 -
5 211 33.27 2 aap RDF 10916 s37 2gf7A

T0580

F# W# GDT-TS M Spieler (Players) Team Score Sb# Templates
1 237 80.05 2 smith92clone, Datstandin, Renton, auntdeen, Krog AD 10617 e13 1iibB
2 281 78.61 3 Madde, TheGUmmer, Dolichwier VC 10622 e10 1iibB
3 333 75.24 1 Mark- Contenders 10681 s1 1iibB
4 383 71.15 5 Tamison, gdnskye, maxwell_thethird, vertex RDF 10367 e16 1iibB
5 406 68.75 4 rmhorton - 10369 s6 1e2bA

T0581

F# W# GDT_TS M Spieler (Players) Team Score Sb# Templates
1 1 70.48 1 Madde, TheGUmmer VC 10753 e1 -
2 5 65.95 2 Pletsch7, dimension9, Renton, auntdeen AD 10750 e4 -
3 6 65.24 5 vakobo, Grom Russian team 10680 e16 -
4 7 63.09 4 Tamison, aap RDF 10692 e14 -
5 8 60.95 3 mimi, Mark- Contenders 10727 e9 -

T0586

2 Domains

F# W# GDT_TS M Spieler (Players) Team Score Sb# Templates
1 425 60.71 2 Bletchley Park, Mark- Contenders 9904 e3 2ek5A 2wv0A
2 436 59.87 5 Commaster Ukraine 9829 s8 2wv0A
3 463 58.82 3 auntdeen, Pletsch AD 9893 e8 3by6A
4 477 55.88 1 aap, Tamison, vertex RDF 9910 e1 2ek5A
5 508 50.00 4 Mad_Max, Grom Russian team 9886 e16 2ek5A 2wv0A

T0590

F# W# GDT_TS M Spieler (Players) Team Score Sb# Templates
1 315 75.00 2 Bletchley Park, Mark- Contenders 11238 e2 1l0qA 2c4xA
2 376 69.79 1 aap RDF 11386 s1 1l0qA 2c4xA
3 391 66.32 5 auntdeen, Datstandin, Pletsch, drjr AD 11075 e12 1l0qA
4 408 60.42 3 rmhorton - 11206 s3 1l0qA 2c4xA
5 409 59.72 4 Madde VC 11128 s6 1l0qA 2c4xA

T0592

F# W# GDT_TS M Spieler (Players) Team Score Sb# Templates
1 279 67.52 1 aap RDF 11232 s1 2kl3A 3fnjA
2 357 64.96 5 philcalhoun Free-DC 11018 s7 2kl3A
3 415 62.41 4 mrmookie - 11086 s5 2kl3A
4 473 56.02 2 BootsMcGraw, Mark- Contenders 11230 e1 2kl3A 3fnjA 1yt8A
5 483 54.56 3 Datstandin, Pletsch7, auntdeen, Pletsch AD 11218 e7 2kl3A 1yt8A 3flhA

T0594

F# W# GDT_TS M Spieler (Players) Team Score Sb# Templates
1 358 74.46 4 dimension9, Pletsch, Krog AD 11345 e10 1x53A
2 494 61.07 3 Madde, TheGUmmer, Dolichwier VC 11357 e7 1x53A
3 512 58.39 2 mimi, spvincent Contenders 11394 e2 1x53A
4 514 58.21 1 aap RDF 11422 s1 1x53A
5 527 50.18 5 mrmookie - 11009 s14 1x53A

T0598

F# W# GDT-TS M Spieler (Players) Team Score Sb# Templates
1 238 57.68 1 spvincent, Mark- Contenders 11529 e1 2osoA
2 346 53.35 4 rmhorton - 11149 s3 2osoA
3 410 42.32 3 Grom, vakobo Russian team 11178 e8 2osoA
4 448 33.86 2 gdnskye, aap RDF 11528 e4 2osoA
5 468 26.77 5 Madde VC 11123 s4 2osoA

T0600

F# W# GDT M Spieler (Players) Team Score Sb# Templates
1 canc. 45,5 3 Bletchley Park, Mark- Contenders 11185 e10 3h9wA
2 canc. 45,1 2 dimension9, Pletsch, superbro AD 11319 e4 3eehA 3mqoA
3 canc. 41,7 5 Brick Free-DC 10980 s11 3eehA
4 canc. 38,5 4 Tamison, vertex RDF 11044 e13 3h9wA
5 canc. 36,0 1 Madde, mat747 VC 11338 e1 3h9wA 3mqoA

T0605

F# W# GDT-TS M Spieler (Players) Team Score Sb# Templates
1 58 89.80 5 Commaster Ukraine 10819 s7 1fzeC
2 314 64.80 4 mat747, Dolichwier VC 10830 e6 1fzeC
3 488 41.33 3 Brick Free-DC 10855 s5 1fzeC
4 506 39.29 1 Marie Suchard - 11049 s1 1fzeC
5 537 36.22 2 Bletchley Park Contenders 11042 s2 1fzeC

T0610

F# W# GDT-TS M Spieler (Players) Team Score Sb# Templates
1 412 61.65 1 Mark- Contenders 12306 s1 1wdjA
2 420 60.23 5 rmhorton - 11894 s6 1wdjC
3 423 58.95 4 Commaster Ukraine 11915 s5 1wdjA
4 444 47.87 2 aap RDF 12096 s3 1wdjA
5 451 44.74 3 steveB VC 11929 s4 1wdjA

T0612

F# W# GDT_TS M Spieler (Players) Team Score Sb# Templates
1 174 53.30 2 Dolichwier, TheGUmmer, mat747 VC 10650 e4 2vzsB
2 200 52.12 1 vakobo, ice--9, Grom Russian team 10710 e1 2x09B
3 254 50.24 3 aap RDF 10597 s3 2vzsA 2vzsB
4 291 47.64 5 philcalhoun Free-DC 10450 s29 2x09B
5 312 46.23 4 CFC, Bletchley Park Contenders 10591 e8 2x09B

T0614

F# W# GDT_TS M Spieler (Players) Team Score Sb# Templates
1 124 83.10 1 Mark- Contenders 10943 s1 2cy5A 1maiA
2 127 82.75 2 steveB VC 10759 s2 1maiA
3 381 63.73 5 rmhorton - 10637 s6 2cy5A 1maiA 3hqcA
4 419 52.82 3 Susanne SETI.Germany 10664 s4 1maiA
5 453 39.09 4 aap RDF 10642 s5 2dkqA

T0616

F# W# GDT-TS M Spieler (Players) Team Score Sb# Templates
1 72 33.76 2 Susanne SETI.Germany 10027 s3 -
2 229 31.19 3 phrodu - 9999 s5 -
3 271 30.41 4 Commaster Ukraine 9990 s6 -
4 283 30.16 5 Grom, ice--9 Russian team 9985 e6 -
5 290 29.90 1 Mark- Contenders 10070 s1 -

T0618

F# W# GDT_TS M Spieler (Players) Team Score Sb# Templates
1 126 27.85 1 Madde, Dolichwier VC 11564 e2 -
2 130 27.53 3 ? ? ? ? -
3 134 27.37 5 Tamison, setiman, Coskun RDF 11513 e9 -
4 136 27.06 2 ? ? ? ? -
5 152 26.74 4 Mark- Contenders 11536 s5 -

T0619

F# W# GDT_TS M Spieler (Players) Team Score Sb# Templates
1 217 76.98 2 setiman, gdnskye RDF 10362 e7 2oxoA
2 431 66.83 5 Commaster Ukraine 10194 s8 2kd1A
3 452 63.37 4 Pletsch, Datstandin AD 10320 e9 2kd1A
4 466 60.89 1 Bletchley Park, Mark-, BootsMcGraw, spvincent, infjamc Contenders 10394 e1 3lysA 1a0pA 2kkpA 2kobA
5 505 49.26 3 rmhorton - 10352 s2 2kd1A

T0622

F# W# GDT_TS M Spieler (Players) Team Score Sb# Templates
1 271 59.02 1 Datstandin, Pletsch AD 11247 e1 2vt3B
2 422 52.66 3 Dolichwier, TheGUmmer, steveB VC 11071 e8 2vt3B 2dt5A
3 450 50.20 4 mimi, Mark- Contenders 11001 e10 2dt5A
4 474 46.72 5 rmhorton - 10895 s6 2dt5A
5 518 38.32 2 Tamison, aap RDF 11198 e5 2dt5A 2py6A 3kuxA

T0624

F# W# GDT_TS M Spieler (Players) Team Score Sb# Templates
1 39 43.84 3 heather-1 - 9392 s46 -
2 61 43.12 2 Jim Fraser Contenders 9522 s34 -
3 98 40.94 4 rav3n_pl BOINC@Poland 9344 s51 -
4 204 37.68 5 rav3n_pl BOINC@Poland 9296 s51 -
5 272 33.70 1 CFC Contenders 9687 s1 -

T0630

F# W# GDT_TS M Spieler (Players) Team Score Sb# Templates
1 212 46.97 3 mimi, BootsMcGraw, spvincent, Bletchley Park, infjamc Contenders 10420 e5 3ebqA 2if6A
2 236 40.91 5 calhoun Free-DC 10116 s10 2hbwA 3ebqA
3 301 33.08 4 Marie Suchard - 10361 s3 2hbwA
4 507 22.22 2 aap RDF 10558 s2 3kw0A
5 537 20.96 1 Dolichwier, TheGUmmer, Madde VC 10689 e1 -

T0643

F# W# GDT_TS M Spieler (Players) Team Score Sb# Templates
1 71 58.90 1 steveB VC 9508 s1 3clcB
2 209 52.05 4 drjr AD 9395 s23 3clcB
3 324 47.95 3 drjr AD 9395 s23 -
4 348 46.58 2 Pletsch AD 9440 s7 -
5 540 29.45 5 Bletchley Park Contenders 9384 s33 -




∗) AD = Anthropic Dreams, RDF = Richard Dawkins Foundation, VC = Void Crushers, AHAP = Another Hour Another Point, CFC = CharlieFortsConscience
F# = Foldit-Rang (Foldit rank), W# = Weltweiter Rang (world wide rank), M = Modell#, Sb# = Rang auf Solo- bzw. Evolver-Scoreboard (ranking on solo or evolver scoreboard)

Die GDT-TS-Werte wurden bereitgestellt von predictioncenter.org
GDT-TS numbers provided by predictioncenter.org

CASP9-Refinement-Puzzles

Nr. Target PDB Bester
Score 		Team Bester
Solo-
score 		Spieler
(Player) 		vom Team Bestes Modell,
Spieler,
Team
R1 TR557 2kyy 11026 Contenders 11026 Mark- Contenders 5, Commaster, Ukraine
R2 TR568 3n6y 10439 Contenders 10439 Mark- Contenders 5, steveB, VC
R3 TR569 2kyw 10081 Contenders 10081 mimi Contenders 5, Mark-, Contenders
R4 TR576 3na2 11111 Contenders 11060 drjr Anthropic Dreams 3, Madde, VC
R5 TR592 3nhv 11339 RDF 11336 vertex RDF 5, spvincent, Contenders
R6 TR594 3ni8 11473 Contenders 11470 Mark- Contenders 2, Coskun, RDF
R7 TR606 3noh 11159 Contenders 11157 Mark- Contenders 1, Mark-, Contenders
R8 TR614 11047 Contenders 11047 BootsMcGraw Contenders 1, BootsMcGraw, Contenders
R8a TR614 11042 Contenders 11041 Mark- Contenders
R8b TR614 11006 Contenders 10997 Mark- Contenders
R9 TR622 3nkl 11122 Contenders 11120 Bletchley Park Contenders 3, Grom, Russian team
R10 TR624 3nrl 9824 Anthropic Dreams 9796 Datstandin Anthropic Dreams
R10t TR624 3nrl 9809 Void Crushers 9800 steveB Void Crushers

GDT-Resultate (Refinement-Puzzles)

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Click on the target numbers to get to the separate articles with pictures of the various models.

TR557

F# W# GDT-TS GDT-HA M Spieler (Players) Team Score Sb#
1 41 67.60 48.00 5 Commaster Ukraine 10882 s4
2 62 66.80 46.60 3 Madde VC 10955 s2
3 72 66.20 46.00 4 vakobo, Grom Russian team 10896 e14
4 78 65.60 45.80 1 Mark- Contenders 11026 s1
5 87 64.20 43.00 2 Tyggy Too, Pletsch7, Krog AD 10971 e5

GDT-TS/GDT-HA des Startmodells: 67.60/48.60
GDT-TS/GDT-HA of the starting model: 67.60/48.60

TR568

F# W# GDT-TS GDT-HA M Spieler (Players) Team Score Sb#
1 7 56.70 37.12 5* steveB VC 10292 s11
2 14 55.93 36.60 2 Madde VC 10193 s34
3 51 54.64 36.59 1 Mark- Contenders 10439 s1
4 96 51.80 31.19 4* g_b - 10110 s55
5 107 50.00 28.61 3* mimi Contenders 10269 s15

∗) Foldit model was run through 1 round of Rosetta idealize and relax

GDT-TS/GDT-HA des Startmodells: 54.90/35.82
GDT-TS/GDT-HA of the starting model: 54.90/35.82

TR569

F# W# GDT-TS GDT-HA M Spieler (Players) Team Score Sb#
1 56 72.47 52.85 5 Mark- Contenders 10058 s3
2 57 72.47 52.85 1 mimi Contenders 10081 s1
3 61 71.83 52.22 3 aap RDF 9971 s22
4 64 71.83 52.53 4 a13ph - 9992 s12
5 67 71.20 51.27 2 vertex RDF 10031 s6

GDT-TS/GDT-HA des Startmodells: 73.10/52.85
GDT-TS/GDT-HA of the starting model: 73.10/52.85

TR576

F# W# GDT-TS GDT-HA M Spieler (Players) Team Score Sb#
1 45 60.87 41.48 3 Madde VC 11052 s2
2 63 58.51 37.86 5 Commaster Ukraine 10965 s6
3 74 57.25 36.05 4 aap RDF 11035 s3
4 92 53.44 33.15 1 mimi, spvincent Contenders 11111 e1
5 98 51.45 31.16 2 drjr AD 11060 s1

GDT-TS/GDT-HA des Startmodells: 65.40/46.92
GDT-TS/GDT-HA of the starting model: 65.40/46.92

TR592

F# W# GDT-TS GDT-HA M Spieler (Players) Team Score Sb#
1 91 86.67 70.00 5 Bletchley Park, spvincent Contenders 10284 e11
2 99 84.76 67.14 2 Madde VC 10304 s2
3 101 84.52 68.10 4 ice--9, Grom Russian team 10286 e8
4 110 82.38 64.29 1 Tamison, vertex RDF 10339 e1
5 121 76.43 56.43 3 drjr AD 10300 s4

GDT-TS/GDT-HA des Startmodells: 90.48/74.05
GDT-TS/GDT-HA of the starting model: 90.48/74.05

TR594

F# W# GDT-TS GDT-HA M Spieler (Players) Team Score Sb#
1 76 81.07 62.50 2 Coskun RDF 11415 s2
2 87 78.21 60.18 1 CFC, Mark- Contenders 11473 e1
3 98 77.14 56.07 5 Datstandin AD 11164 s9
4 128 70.00 48.75 3 pk009 SETI.Germany 11273 s4
5 131 68.04 50.72 4 TheGUmmer, mat747 VC 11234 e5

GDT-TS/GDT-HA des Startmodells: 86.61/67.50
GDT-TS/GDT-HA of the starting model: 86.61/67.50

TR606

F# W# GDT-TS GDT-HA M Spieler (Players) Team Score Sb#
1 69 68.29 48.17 1 Bletchley Park, Mark- Contenders 11159 e1
2 85 66.06 45.53 5 Judecca AHAP 10900 s6
3 104 63.21 41.87 3 ice--9, Grom, vakobo Russian team 10940 e5
4 108 62.80 43.70 4 drjr AD 10935 s4
5 123 54.27 35.16 2 aap RDF 11005 s2

GDT-TS/GDT-HA des Startmodells: 71.95/53.25
GDT-TS/GDT-HA of the starting model: 71.95/53.25

TR614

F# W# GDT-TS GDT-HA M Spieler (Players) Team Score Sb#
1 1 75.21 59.71 1 BootsMcGraw Contenders 11047 s1
2 9 72.73 54.75 4 g_b - 10880 s5(a)
3 16 70.45 52.27 2 mimi, Mark- Contenders ? ?
4 41 67.56 48.55 3 steveB VC ? ?
5 61 65.70 47.73 5 ice--9, Grom, vakobo Russian team 10873 e6

TR622

F# W# GDT-TS GDT-HA M Spieler (Players) Team Score Sb#
1 81 64.14 47.13 3 ice--9, Grom Russian team 11031 e6
2 83 63.93 46.11 5 drjr AD 10939 s11
3 93 61.27 46.31 2 mat747 VC 11034 s4
4 101 60.04 43.44 4 Bletchley Park Contenders 11120 s1
5 109 58.40 39.55 1 CFC Contenders 10987 s7

GDT-TS/GDT-HA des Startmodells: 67.42/49.38
GDT-TS/GDT-HA of the starting model: 67.42/49.38

CASP9-last-Puzzles

Nr. Target PDB Bester
Score 		Team Bester
Soloscore 		Spieler
(Player) 		vom Team
38 T0552 2l3b 11062 Anthropic Dreams 10919 mimi Contenders
39 T0545 2l3f 11939 Anthropic Dreams 11922 jakyl Anthropic Dreams
40 T0546 canceled 11175 Anthropic Dreams 11123 Pletsch Anthropic Dreams
41 T0577 canceled 10972 Anthropic Dreams 10965 keypad5 Anthropic Dreams
42 T0554 canceled 11349 Team Tornado 11387 tim1079
43 T0583 canceled 12083 Anthropic Dreams 12083 Stardancer Anthropic Dreams
44 T0595 canceled 11105 Anthropic Dreams 11105 prot-bustr Anthropic Dreams

CASP9-Scoreboards

Alle Puzzles

Teams

CASP9-Teamwertung (alle Puzzles)1
Team Punkte Gold Silber Bronze
Contenders 4411 28 13 9
Void Crushers 3346 7 20 13
Richard Dawkins Foundation 3048 13 8 8
Anthropic Dreams 2638 5 9 11
Russian team 1636 1 1 7
Free-DC ↑1 859 1 3 0
SETI.Germany ↓1 853 1 1 2
Ukraine 548 0 1 1
Another Hour Another Point 500 0 0 2
Natural Abilities 303 0 0 0
Skeptics Guide to the Universe 254 0 0 1
BOINC@Poland 227 0 0 0
Oma Gawd 131 0 0 1
Boinc.be 122 0 0 0
Segment is locked 87 0 0 1
There Will Be Cake 49 0 0 0


Solos

CASP9-Solospielerwertung (alle Puzzles)1
Spieler Punkte Gold Silber Bronze Team
Mark- 4974 15 9 8 Contenders
mimi 3798 2 4 1 Contenders
aap 3615 12 6 4 Richard Dawkins Foundation
CharlieFortsConscience 3536 5 3 4 Contenders
steveB 3474 3 5 5 Void Crushers
mat747 3438 0 2 6 Void Crushers
BootsMcGraw 3198 1 2 2 Contenders
Madde 3138 5 6 1 Void Crushers
vertex 3054 2 0 1 Richard Dawkins Foundation
Bletchley Park 3038 1 2 2 Contenders
Grom ↑1 2901 0 0 2 Russian team
Dolichwier ↓1 2854 0 1 0 Void Crushers
Pletsch ↑2 2768 1 1 1 Anthropic Dreams
drjr 2722 1 0 0 Anthropic Dreams
TheGUmmer ↓2 2702 0 0 4 Void Crushers
g_b 2449 0 0 0 -
HillObserver 2384 1 1 2 Void Crushers
spvincent 2285 0 2 0 Contenders
vakobo 2204 0 0 0 Russian team
philcalhoun 2160 0 0 0 Free-DC
infjamc ↑1 2105 0 0 1 Contenders
Jim Fraser ↓1 2039 0 0 1 Contenders
Datstandin ↑1 2004 1 0 0 Anthropic Dreams
Susanne ↓1 1954 1 0 2 SETI.Germany
Brick 1849 0 1 0 Free-DC
dimension9 1778 0 1 0 Anthropic Dreams
tallguy-13088 1600 0 1 0 -
Marie Suchard 1541 1 0 1 -
rmhorton 1484 0 1 2 -
auntdeen 1473 0 1 0 Anthropic Dreams
Commaster 1460 0 1 0 Ukraine
SKSbell 1405 0 0 0 -
Renton 1394 0 1 0 Anthropic Dreams
keypad5 1369 0 2 0 Richard Dawkins Foundation
Coskun ↑2 1319 0 1 1 Richard Dawkins Foundation
Cartoon Villain ↓1 1290 1 1 0 -
pk009 ↓1 1260 0 0 0 SETI.Germany
cadeh_cam111 1071 1 0 0 -
Krog 958 0 0 0 Anthropic Dreams
reed 920 0 0 0 Skeptics Guide to the Universe
Perzik 867 0 0 0 Boinc.be
gdnskye ↑1 770 1 0 0 Richard Dawkins Foundation
mrmookie ↓1 734 0 0 0 -
Ell ↑1 609 0 0 0 Segment is locked
xiando ↓1 594 1 0 0 Oma Gawd
Tyggy Too 543 0 0 0 Anthropic Dreams
Ocire 446 0 0 1 Anthropic Dreams
phrodu 428 0 0 0 -
MellyLam 307 0 0 1 Another Hour Another Point
BikeLoup 249 0 1 0 Another Hour Another Point
Rusty76 227 0 0 1 -
blueglow neu 143 0 0 1 -
Endoplasmic Ridiculus ↓1 113 0 0 1 Anthropic Dreams

¹) Berücksichtigt wurden nur Teams und Solospieler, die in mindestens einem CASP9-Puzzle unter die besten 5 gekommen sind.
There are only teams and solo players on the scoreboards who achieved at least one top5-rank in a CASP9 puzzle.


Standardpuzzles

Teams

CASP9-Teamwertung (Standardpuzzles)2
Team Punkte Gold Silber Bronze
Contenders 3273 18 12 9
Void Crushers 2575 6 16 9
Richard Dawkins Foundation 2437 12 5 7
Anthropic Dreams 1987 4 6 9
Russian team 1064 1 1 3
Free-DC 687 1 2 0
SETI.Germany 653 1 1 1
Ukraine 387 0 0 1
Another Hour Another Point 325 0 0 2
Natural Abilities 256 0 0 0
Skeptics Guide to the Universe 187 0 0 1
Boinc.be 104 0 0 0
Oma Gawd 94 0 0 1
There Will Be Cake 49 0 0 0


Solos

CASP9-Solospielerwertung (Standardpuzzles)2
Spieler Punkte Gold Silber Bronze Team
Mark- 3823 9 9 7 Contenders
aap 2881 12 5 2 Richard Dawkins Foundation
mimi 2812 1 2 0 Contenders
CharlieFortsConscience 2704 5 3 4 Contenders
steveB 2661 2 3 5 Void Crushers
mat747 2475 0 1 3 Void Crushers
BootsMcGraw 2416 0 2 1 Contenders
Madde 2308 5 3 1 Void Crushers
Bletchley Park 2245 0 2 2 Contenders
TheGUmmer 2142 0 0 4 Void Crushers
Dolichwier 2128 0 1 0 Void Crushers
vertex 2069 1 0 1 Richard Dawkins Foundation
Pletsch 2015 1 1 1 Anthropic Dreams
Grom 1988 0 0 1 Russian team
drjr 1908 0 0 0 Anthropic Dreams
HillObserver 1701 1 1 2 Void Crushers
philcalhoun 1562 0 0 0 Free-DC
vakobo 1530 0 0 0 Russian team
infjamc 1509 0 0 1 Contenders
rmhorton 1484 0 1 2 -
spvincent 1410 0 2 0 Contenders
Susanne 1390 1 0 2 SETI.Germany
Datstandin 1319 0 0 0 Anthropic Dreams
keypad5 1307 0 2 0 Richard Dawkins Foundation
dimension9 1298 0 1 0 Anthropic Dreams
Brick 1218 0 0 0 Free-DC
Marie Suchard 1188 1 0 1 -
tallguy-13088 1120 0 1 0 -
Commaster 1118 0 0 0 Ukraine
auntdeen 1073 0 1 0 Anthropic Dreams
cadeh_cam111 1018 1 0 0 -
Cartoon Villain 1003 1 1 0 -
Krog 834 0 0 0 Anthropic Dreams
mrmookie 643 0 0 0 -
Perzik 614 0 0 0 Boinc.be
gdnskye 563 1 0 0 Richard Dawkins Foundation
Ocire 446 0 0 1 Anthropic Dreams
Tyggy Too 376 0 0 0 Anthropic Dreams
MellyLam 307 0 0 1 Another Hour Another Point
xiando 275 1 0 0 Oma Gawd
BikeLoup 249 0 1 0 Another Hour Another Point
phrodu 162 0 0 0 -
Endoplasmic Ridiculus 113 0 0 1 Anthropic Dreams

²) Berücksichtigt wurden nur Teams und Solospieler, die in mindestens einem Puzzle unter die besten 5 gekommen sind. Puzzles 1a-37.
There are only teams and solo players on the scoreboards who achieved at least one top5-rank in a CASP9 standard-puzzle.


Refinement-Puzzles

Teams

CASP9-Teamwertung (Refinement-Puzzles)3
Team Punkte Gold Silber Bronze
Contenders 1138 10 1 0
Void Crushers 771 1 4 4
Anthropic Dreams ↑1 651 1 3 2
Richard Dawkins Foundation ↓1 611 1 3 1
Russian team 572 0 0 4
SETI.Germany 200 0 0 1
Another Hour Another Point ↑2 175 0 0 0
Free-DC 172 0 1 0
Ukraine ↓2 161 0 1 0
BOINC@Poland 107 0 0 0
Segment is locked 87 0 0 1
Skeptics Guide to the Universe 67 0 0 0


Solos

CASP9-Solospielerwertung (Refinement-Puzzles)3
Spieler Punkte Gold Silber Bronze Team
Mark- 1151 6 0 1 Contenders
mimi ↑2 986 1 2 1 Contenders
vertex ↓1 985 1 0 0 Richard Dawkins Foundation
mat747 ↓1 963 0 1 3 Void Crushers
Grom 913 0 0 1 Russian team
spvincent ↑2 875 0 0 0 Contenders
Madde ↓1 830 0 3 0 Void Crushers
drjr ↓1 814 1 0 0 Anthropic Dreams
steveB ↑1 813 1 2 0 Void Crushers
Bletchley Park ↑1 793 1 0 0 Contenders
BootsMcGraw ↓2 782 1 0 1 Contenders
Pletsch ↑1 753 0 0 0 Anthropic Dreams
aap ↓1 734 0 1 2 Richard Dawkins Foundation
Datstandin ↑2 685 1 0 0 Anthropic Dreams
HillObserver neu 683 0 0 0 Void Crushers
g_b ↓2 683 0 0 0 -
Coskun 637 0 1 1 Richard Dawkins Foundation
Brick ↓3 631 0 1 0 Free-DC
SKSbell ↓1 574 0 0 0 -
Jim Fraser ↓1 568 0 0 1 Contenders
Ell ↓1 555 0 0 0 Segment is locked
pk009 ↓1 469 0 0 0 SETI.Germany
Renton ↓1 460 0 1 0 Anthropic Dreams
Commaster ↓1 342 0 1 0 Ukraine
reed ↓1 316 0 0 0 Skeptics Guide to the Universe
phrodu ↓1 266 0 0 0 -
Rusty76 ↓1 227 0 0 1 -
blueglow neu 143 0 0 1 -
mrmookie ↓2 91 0 0 0 -

³) Berücksichtigt wurden nur Teams und Solospieler, die in mindestens einem Puzzle unter die besten 5 gekommen sind. Puzzles R1-R10t.
There are only teams and solo players on the scoreboards who achieved at least one top5-rank in a CASP9 refinement puzzle.

Literatur

bild der wissenschaft Ausgabe: 4/2010, Seite 18 - Formvollendet - Artikel über Proteinstrukturvorhersage und CASP

NZZ am Sonntag vom 19.09.2010, Seite 57 - Die WM der Biologen PDF (0,4 MB)

Quellen

  1. ↑ http://www.predictioncenter.org/news.cgi#15
  2. ↑ http://fold.it/portal/node/165875
  3. ↑ http://fold.it/portal/node/273682
  4. ↑ http://fold.it/portal/node/729520
  5. ↑ http://predictioncenter.org/casp9/index.cgi#timetable
  6. ↑ http://fold.it/portal/node/987474
  7. ↑ http://www.predictioncenter.org/casp9/index.cgi?page=format
  8. ↑ http://fold.it/portal/node/987474
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