Foldit
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Änderungen: CASP

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GDT-TS des besten Rosetta-Modells: 68,8 - GDT-TS des besten Servermodells: 72,7 (PconsD)<br>
  
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''GDT-TS of the best Rosetta model: 68.8 - GDT-TS of the best server model: 72.7 (PconsD)''
  
   
 
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Version vom 16. August 2011, 09:52 Uhr

"CASP (Critical Assessment of Techniques for Protein Structure Prediction; dt.: kritische Überprüfung von Techniken zur Vorhersage von Proteinstrukturen) ist ein seit 1994 zweijährig stattfindendes Gemeinschaftsexperiment (häufig auch als Wettbewerb bezeichnet),[...].

CASP bietet Forschergruppen die Möglichkeit, die Qualität ihrer Methoden zur Vorhersage von Proteinstrukturen ausgehend von der Primärstruktur zu testen und sich einen Überblick über den aktuellen Stand auf diesem Forschungsgebiet zu verschaffen.

Dazu werden noch nicht veröffentlichte Proteinstrukturen als Vorgabe für die Berechnungen verwendet und die Ergebnisse der Berechnungen dann mit experimentellen Laborergebnissen verglichen."
(Auszug aus dem deutschen Wikipedia-Artikel)


Mini-CASP

Bei Mini-CASP-Puzzlen wird die Tertiärstruktur, die während der Laufzeit der einzelnen Puzzle noch unbekannt ist, schon kurz nach Beendigung bekanntgegeben. Sie haben mit dem CASP-Wettbewerb nichts zu tun, werden aber vom Foldit-Team und den Spielern dazu genutzt, sich auf ihn vorzubereiten.


CASP8

Foldit war das erste Mal (allerdings nur als Teil des BakerLab-Teams) beim achten Wettbewerb (CASP8) vertreten, welcher 2008 stattfand. Zur Vorbereitung wurden von den Spielern alte CASP7-Proteine gefaltet und die Ergebnisse von den Entwicklern mit den veröffentlichten Strukturen verglichen.

Einige Tage nach dem Start von CASP8[1] wurde gerade einmal die erste offene Betaversion von Foldit veröffentlicht.[2] Die Spieler und Entwickler haben dann einen Monat lang trainiert und das Programm weiterentwickelt, bevor sie sich an ihrem ersten CASP8-Puzzle versuchten.[3] Aufgrund dessen haben sie sich auch nur an relativ wenigen Targets des Wettbewerbs beteiligt. Trotz dieser Handicaps waren einige Plätze in den Top 3 und sogar ein Sieg die sehr guten Ergebnisse. Insgesamt waren die Foldit-Spieler genauso gut wie die Experten mit all ihren Werkzeugen und besser als alle vollautomatischen Computereinsendungen.[4]


CASP9

CASP9 fand vom 3. Mai bis zum 20. August 2010 statt, Ergebnisse werden im November/Dezember 2010 bekanntgegeben.[5]
Beim CASP9 trat Foldit erstmals als eigenständiges Team auf.[6]
Jedes Team (in diesem Fall ist das Foldit-Team als Ganzes gemeint, nicht die einzelnen Gruppen innerhalb von Foldit) konnte pro Target bis zu 5 verschiedene Vorhersagen abgeben.[7] Das Foldit-Team hat auf jeden Fall die Vorhersage mit dem höchsten Score eingesandt. Es war angedacht, die vier weiteren Einsendungen von den Spielern mittels Solution Voting Puzzles aus mehreren hoch punktenden Vorhersagen auswählen zu lassen.[8] Dies wurde jedoch verworfen.

CASP9-Puzzles

Nr. Target PDB Bester
Score 		Team Bester
Solo-
score 		Spieler
(Player) 		vom Team Bestes Modell,
Spieler,
Team
1a T0520 3mr7 12425 Contenders 12425 Mark- Contenders 1, Mark-, Cont.
1b T0520 3mr7 12273 AD* 12218 aap RDF 2, aap, RDF
1c T0520 3mr7 12047 Void Crushers 12038 Madde Void Crushers 5, Madde, VC
2a T0523 3mqo 10848 RDF* 10848 aap RDF 2, Mark-, Cont.
2b T0523 3mqo 10742 Contenders 10742 Mark- Contenders 5, Mark-, Cont.
2c T0523 3mqo 10777 RDF 10777 aap RDF 3, aap, RDF
2d T0523 3mqo 10943 RDF 10943 aap RDF 4, HillObserver, VC
3a T0527 3mr0 11794 Contenders 11760 steveB Void Crushers 1, CFC, Cont.
3b T0527 3mr0 11615 RDF 11615 aap RDF 5, aap, RDF
4 T0525 3mqz 12639 RDF 12639 aap RDF 2, Mark-, Cont.
5 T0538 2l09 9449 Contenders 9449 Mark- Contenders 3, Tessa, AD
6 T0540 10068 AD 9973 vertex RDF
7 T0544 11239 Contenders 11197 mimi Contenders
8 T0553 2ky4 11367 Contenders 11345 HillObserver Void Crushers 5, Russian team
9 T0564 2l0c 10266 Contenders 10266 CFC* Contenders 5, cadeh_cam111
10 T0556 - 9691 Contenders 9681 CFC Contenders canceled
11 T0566 3n72 11634 RDF 11634 aap RDF 5, AD
12 T0568 3n6y 11723 SETI.Germany 11723 Susanne SETI.Germany 1, Susanne, SETI.G
13 T0569 2kyw 9798 Free-DC 9770 Cartoon Villain - 1, philcalhoun, Free-DC
14 T0561 11692 Contenders 11692 CFC Contenders
15 T0576 3na2 11283 RDF 11283 aap RDF 2, AD
16 T0578 3nat 11839 Contenders 11839 CFC Contenders 2, mat747, VC
17 T0579 2ky9 11194 Void Crushers 11194 Madde Void Crushers 1, Madde, VC
18 T0580 3nbm 10681 Contenders 10681 Mark- Contenders 2, Krog, AD
19 T0586 3neu 9910 RDF 9903 Mark- Contenders 5, Commaster, Ukraine
20 T0590 2kzw 11386 RDF 11386 aap RDF 2, Mark-, Cont.
21 T0592 3nhv 11232 RDF 11232 aap RDF 1, aap, RDF
22 T0594 3ni8 11422 RDF 11422 aap RDF 4, Krog, AD
23 T0581 3npd 10753 Void Crushers 10749 Madde Void Crushers 1, Madde, VC
24 T0598 3njc 11529 Contenders 11528 Mark- Contenders 1, Mark-, Cont.
25 T0600 3nja 11338 Void Crushers 11336 Madde Void Crushers 3, superbro, AD
26 T0610 3ot2 12306 Contenders 12306 Mark- Contenders 1, Mark-, Cont.
27 T0612 3o0l 10710 Russian team 10634 xiando Oma Gawd 2, mat747, VC
28 T0614 10943 Contenders 10943 Mark- Contenders
29 T0616 3nrt 10070 Contenders 10070 Mark- Contenders 2, Susanne, Seti.G
30 T0605 3nmd 10049 - 10049 Marie Suchard - 5, Commaster, Ukraine
31 T0622 3nkl 10247 AD 10247 Pletsch AD 1, Datstandin, AD, 62
32 T0619 3nrw 10394 Contenders 10353 gdnskye RDF 2, setiman, RDF, 81.2
33 T0618 3nrh 10566 AD 10564 cadeh_cam111 -
34 T0624 3nrl 9687 Contenders 9687 CFC Contenders 2, Jim Fraser, Cont., 41.7
3, heather-1, -, 41.7
35 T0562 2kzx 10867 RDF 10867 aap RDF 1, aap, RDF
36 T0630 2kty 10689 Void Crushers 10660 Madde Void Crushers
37 T0643 3nzl 9508 Void Crushers 9508 steveB Void Crushers


∗) AD = Anthropic Dreams, RDF = Richard Dawkins Foundation, VC = Void Crushers, CFC = CharlieFortsConscience

GDT-Resultate (Standardpuzzles)

Klicken Sie auf die Targetnummern um zu den jeweiligen Einzelartikeln mit Bildern der verschiedenen Modelle zu kommen.
Click on the target numbers to get to the separate articles with pictures of the various models.

T0520

F# W# GDT_TS M Spieler (Players) Team Score Sb# Templates
1 265 74.42 1 Mark- Contenders 12445 s1(a) 1fx4A
2 351 72.69 4 Marie Suchard - 12171 s4(a) 1fx4A
3 439 69.08 5 Madde, Dolichwier VC 12047 e1(c) 1azsB
4 463 67.49 2 aap, keypad5 RDF 12246 e8(b) 1wc1A
5 499 63.73 3 smith92clone, Renton, Crashguard303, dimension9, Datstandin, Pletsch AD 12273 e1(b) 1wc1A

T0523

F# W# GDT_TS M Spieler (Players) Team Score Sb# Templates
1 256 76.35 4 TheGUmmer, HillObserver VC 10766 e10(d) 3lyxA
2 374 69.82 2 mimi, Mark- Contenders 10842 e3(a) 2v1aA
3 468 63.06 5 Mark- Contenders 10742 s1(b) 2pd7A
4 472 62.16 1 aap RDF 10943 s1(d) 3lyxA
5 492 51.80 3 keypad5, aap RDF 10777 e1(c) 1bywA

T0525

F# W# GDT_TS M Spieler (Players) Team Score Sb# Templates
1 74 63.90 2 Mark-, Bletchley Park Contenders 12447 e5 2a8eA
2 243 56.59 5 rmhorton - 12365 s4 2a8eA
3 244 55.85 3 smith92clone, Pletsch, Renton AD 12386 e12 2a8eA
4 258 53.05 4 Dolichwier, HillObserver, TheGUmmer, steveB VC 12456 e2 2a8eA
5 265 41.95 1 aap RDF 12639 s1 2a8eA

T0527

F# W# GDT_TS M Spieler (Players) Team Score Sb# Templates
1 10 79.04 1 CFC, Mark- Contenders 11794 e1(a) 3h9wA
2 147 72.73 3 Renton, jakyl, dimension9, smith92clone, Pletsch, auntdeen AD 11743 e9(a) 3h9wA
3 262 68.18 2 mat747, Dolichwier, steveB VC 11771 e5(a) 3eehA
4 277 67.42 4 Tamison, setiman, maxwell_thethird, gdnskye, keypad5 RDF 11620 e19(a) 3eehA
5 346 61.11 5 aap RDF 11615 s1(b) 2z6dA

T0538

F# W# GDT_TS M Spieler (Players) Team Score Sb# Templates
1 3 92.45 3 Pletsch7, Renton, Pletsch, smith92clone, Tessa AD 9375 e7 2kruA
2 7 90.57 1 Mark- Contenders 9449 s1 2kruA
3 10 89.15 2 Dolichwier, TheGUmmer VC 9420 e4 2kruA
4 11 89.15 5 superbro - 9338 s12 2kruA
5 15 86.32 4 vertex RDF 9357 s10 2kruA

T0553

(2 Domains)

F# W# GDT_TS M Spieler (Players) Team Score Sb# Templates
1 179 27.98 5 Grom, vakobo Russian team 11228 e21 -
2 203 27.43 3 setiman, aap RDF 11345 e6 -
3 236 27.05 2 Dolichwier, TheGUmmer, HillObserver VC 11355 e4 -
4 237 26.87 1 mimi, CFC Contenders 11367 e1 -
5 245 26.68 4 Ocire, Pletsch, Renton, Datstandin, auntdeen AD 11344 e7 -

T0556

F# W# GDT M Spieler (Players) Team Score Sb# Templates
- - - 1 CFC, infjamc Contenders 9691 e1 3clcB
- - - 2 Datstandin, Krog AD 9670 e5 3clcB
- - - 3 Dolichwier, mat747 VC 9658 e8 3clcB
- - - 4 thom001 - 9645 s7 3clcB
- - - 5 Brick Free-DC 9643 s8 3clcB

T0562

F# W# GDT-TS M Spieler (Players) Team Score Sb# Templates
1 155 31.10 1 aap RDF 10867 s1 3lwxA
2 331 26.22 4 cadeh_cam111 - 10516 s5 3lwxA
3 356 25.20 3 mimi, Mark-, Bletchley Park, CFC Contenders 10773 e6 3lwxA
4 410 22.76 5 Datstandin AD 10479 s8 3lwxA
5 437 20.73 2 steveB, Madde VC 10840 e1 3lwxA

T0564

F# W# GDT_TS M Spieler (Players) Team Score Sb# Templates
1 216 43.03 5 cadeh_cam111 - 10191 s7 -
2 237 41.80 4 Dolichwier, steveB VC 10201 e13 -
3 239 41.80 2 auntdeen, Pletsch, Datstandin, Ocire AD 10254 e5 -
4 240 41.39 3 BikeLoup, lou AHAP 10226 e9 -
5 256 40.16 1 CFC Contenders 10266 s1 -

T0566

F# W# GDT_TS M Spieler (Players) Team Score Sb# Templates
1 375 64.86 5 Datstandin, Pletsch, Pletsch7, smith92clone, jakyl AD 11271 e12 1ubvF
2 394 62.59 2 Dolichwier, Madde VC 11513 e4 1ubvH
3 414 60.31 4 mimi, Mark- Contenders 11488 e6 1ubvD
4 425 59.27 3 BikeLoup AHAP 11507 s2 1ubvD
5 442 51.92 1 aap RDF 11634 s1 1ubvF

T0568

F# W# GDT M Spieler (Players) Team Score Sb# Templates
1 ? 37,9 1 Susanne SETI.Germany 11723 s1 2pn5A
2 ? 36,0 4 cadeh_cam111 - 11596 s5 2pn5A
3 ? 34,5 3 CFC Contenders 11636 s3 2pn5A
3 ? 34,5 5 Datstandin, Pletsch7, Pletsch AD 11573 e8 2pn5A
5 ? 34,4 2 Madde VC 11674 s2 2pn5A

GDT-TS des besten Rosetta-Modells: 43,5 - GDT-TS des besten Servermodells: 43,5 (BAKER-ROSETTASERVER)
GDT-TS of the best Rosetta model: 43.5 - GDT-TS of the best server model: 43.5 (BAKER-ROSETTASERVER)

T0569

F# W# GDT M Spieler (Players) Team Score Sb# Templates
1 ? 50,4 1 philcalhoun, Brick Free-DC 9798 e1 2kvzA 3i57
2 ? 49,6 5 mimi, Mark- Contenders 9741 e7 2kvzA 3i57
3 ? 40,3 2 Cartoon Villain - 9770 s1 2kvzA 3i57
4 ? 28,6 3 Dolichwier, TheGUmmer, mat747, Madde VC 9758 e3 2kvzA 3i57
5 ? 21,3 4 aap RDF 9749 s2 2kvzA 3i57

GDT-TS des besten Rosetta-Modells: 72,2 - GDT-TS des besten Servermodells: 72,2 (BAKER-ROSETTASERVER)
GDT-TS of the best Rosetta model: 72.2 - GDT-TS of the best server model: 72.2 (BAKER-ROSETTASERVER)

T0576

F# W# GDT M Spieler (Players) Team Score Sb# Templates
1 ? 26,1 2 dimension9, Pletsch7, smith92clone, auntdeen, Marktoo AD 11220 e3 -
2 ? 24,8 3 mimi, CFC, Bletchley Park, Mark-, spvincent, infjamc Contenders 11210 e9 -
3 ? 24,6 5 Susanne SETI.Germany 11179 s3 -
4 ? 23,8 1 aap RDF 11283 s1 -
4 ? 23,8 4 Cartoon Villain - 11184 s2 -

GDT-TS des besten Rosetta-Modells: 29,5 - GDT-TS des besten Servermodells: 63,0 (Seok-server)
GDT-TS of the best Rosetta model: 29.5 - GDT-TS of the best server model: 63.0 (Seok-server)

T0578

F# W# GDT M Spieler (Players) Team Score Sb# Templates
1 ? 19,9 2 mat747 VC 11785 s3 -
2 ? 14,9 5 Cartoon Villain - 11725 s8 -
3 ? 14,6 1 CFC Contenders 11839 s1 -
4 ? 14,4 3 vakobo, Grom Russian team 11781 e4 -
5 ? 14,2 4 Pletsch AD 11708 s12 -

GDT-TS des besten Rosetta-Modells: 21,3 - GDT-TS des besten Servermodells: 31,4 (Zhang-Server)
GDT-TS of the best Rosetta model: 21.3 - GDT-TS of the best server model: 31.4 (Zhang-Server)

T0579

F# W# GDT M Spieler (Players) Team Score Sb# Templates
1 ? 41,9 1 Madde VC 11194 s1 -
2 ? 41,3 3 CFC Contenders 11171 s2 -
3 ? 41,1 4 Grom Russian team 11133 s3 -
4 ? 38,9 5 smith92clone, Datstandin, Renton AD 11056 e13 -
5 ? 31,0 2 aap RDF 10916 s37 2gf7A

GDT-TS des besten Rosetta-Modells: 42,3 - GDT-TS des besten Servermodells: 45,6 (Zhang-Server)
GDT-TS of the best Rosetta model: 42.3 - GDT-TS of the best server model: 45.6 (Zhang-Server)

T0580

F# W# GDT-TS M Spieler (Players) Team Score Sb# Templates
1 ? 79,33 2 smith92clone, Datstandin, Renton, auntdeen, Krog AD 10617 e13 1iibB
2 ? 78,13 3 Madde, TheGUmmer, Dolichwier VC 10622 e10 1iibB
3 ? 75,00 1 Mark- Contenders 10681 s1 1iibB
4 ? 71,88 5 Tamison, gdnskye, maxwell_thethird, vertex RDF 10367 e16 1iibB
5 ? 69,23 4 rmhorton - 10369 s6 1e2bA

GDT-TS des besten Rosetta-Modells: 87,7 - GDT-TS des besten Servermodells: 87,7 (BAKER-ROSETTASERVER)
GDT-TS of the best Rosetta model: 87.7 - GDT-TS of the best server model: 87.7 (BAKER-ROSETTASERVER)

T0581

F# W# GDT_TS M Spieler (Players) Team Score Sb# Templates
1 1 70.48 1 Madde, TheGUmmer VC 10753 e1 -
2 5 65.95 2 Pletsch7, dimension9, Renton, auntdeen AD 10750 e4 -
3 6 65.24 5 vakobo, Grom Russian team 10680 e16 -
4 7 63.09 4 Tamison, aap RDF 10692 e14 -
5 8 60.95 3 mimi, Mark- Contenders 10727 e9 -

T0586

F# W# GDT M Spieler (Players) Team Score Sb# Templates
1 ? 60,5 5 Commaster Ukraine 9829 s8 2wv0A
2 ? 60,2 2 Bletchley Park, Mark- Contenders 9904 e3 2ek5A 2wv0A
3 ? 59,0 3 auntdeen, Pletsch AD 9893 e8 3by6A
4 ? 56,5 1 aap, Tamison, vertex RDF 9910 e1 2ek5A
5 ? 50,8 4 Mad_Max, Grom Russian team 9886 e16 2ek5A 2wv0A

GDT-TS des besten Rosetta-Modells: 72,5 - GDT-TS des besten Servermodells: 83,6 (pro-sp3-TASSER)
GDT-TS of the best Rosetta model: 72.5 - GDT-TS of the best server model: 83.6 (pro-sp3-TASSER)

T0590

F# W# GDT M Spieler (Players) Team Score Sb# Templates
1 ? 43,2 2 Bletchley Park, Mark- Contenders 11238 e2 1l0qA 2c4xA
2 ? 37,2 1 aap RDF 11386 s1 1l0qA 2c4xA
3 ? 36,4 5 auntdeen, Datstandin, Pletsch, drjr AD 11075 e12 1l0qA
4 ? 34,9 3 rmhorton - 11206 s3 1l0qA 2c4xA
5 ? 31,5 4 Madde VC 11128 s6 1l0qA 2c4xA

GDT-TS des besten Rosetta-Modells: 46,0 - GDT-TS des besten Servermodells: 46,4 (gws)
GDT-TS of the best Rosetta model: 46.0 - GDT-TS of the best server model: 46.4 (gws)

T0592

F# W# GDT M Spieler (Players) Team Score Sb# Templates
1 ? 70,6 1 aap RDF 11232 s1 2kl3A 3fnjA
2 ? 68,2 5 philcalhoun Free-DC 11018 s7 2kl3A
3 ? 64,6 4 mrmookie - 11086 s5 2kl3A
4 ? 59,4 2 BootsMcGraw, Mark- Contenders 11230 e1 2kl3A 3fnjA 1yt8A
5 ? 57,8 3 Datstandin, Pletsch7, auntdeen, Pletsch AD 11218 e7 2kl3A 1yt8A 3flhA

GDT-TS des besten Rosetta-Modells: 68,8 - GDT-TS des besten Servermodells: 74,8 (RaptorX-MSA)
GDT-TS of the best Rosetta model: 68.8 - GDT-TS of the best server model: 74.8 (RaptorX-MSA)

T0594

F# W# GDT M Spieler (Players) Team Score Sb# Templates
1 ? 77,0 4 dimension9, Pletsch, Krog AD 11345 e10 1x53A
2 ? 61,1 3 Madde, TheGUmmer, Dolichwier VC 11357 e7 1x53A
3 ? 59,7 2 mimi, spvincent Contenders 11394 e2 1x53A
4 ? 58,9 1 aap RDF 11422 s1 1x53A
5 ? 48,3 5 mrmookie - 11009 s14 1x53A

GDT-TS des besten Rosetta-Modells: 74,5 - GDT-TS des besten Servermodells: 85,2 (MUFOLD-MD)
GDT-TS of the best Rosetta model: 74.5 - GDT-TS of the best server model: 85.2 (MUFOLD-MD)

T0598

F# W# GDT-TS M Spieler (Players) Team Score Sb# Templates
1 ? 54,69 1 spvincent, Mark- Contenders 11529 e1 2osoA
2 ? 49,83 4 rmhorton - 11149 s3 2osoA
3 ? 39,24 3 Grom, vakobo Russian team 11178 e8 2osoA
4 ? 30,90 2 gdnskye, aap RDF 11528 e4 2osoA
5 ? 25,69 5 Madde VC 11123 s4 2osoA

GDT-TS des besten Rosetta-Modells: 61,5 - GDT-TS des besten Servermodells: 61,5 (BAKER-ROSETTASERVER)
GDT-TS of the best Rosetta model: 61.5 - GDT-TS of the best server model: 61.5 (BAKER-ROSETTASERVER)

T0600

F# W# GDT M Spieler (Players) Team Score Sb# Templates
1 canc. 45,5 3 Bletchley Park, Mark- Contenders 11185 e10 3h9wA
2 canc. 45,1 2 dimension9, Pletsch, superbro AD 11319 e4 3eehA 3mqoA
3 canc. 41,7 5 Brick Free-DC 10980 s11 3eehA
4 canc. 38,5 4 Tamison, vertex RDF 11044 e13 3h9wA
5 canc. 36,0 1 Madde, mat747 VC 11338 e1 3h9wA 3mqoA

GDT-TS des besten Rosetta-Modells: 46,1 - GDT-TS des besten Servermodells: 48,1 (pro-sp3-TASSER)
GDT-TS of the best Rosetta model: 46.1 - GDT-TS of the best server model: 48.1 (pro-sp3-TASSER)

T0605

F# W# GDT-TS M Spieler (Players) Team Score Sb# Templates
1 ? 83,96 5 Commaster Ukraine 10819 s7 1fzeC
2 ? 64,15 4 mat747, Dolichwier VC 10830 e6 1fzeC
3 ? 37,74 3 Brick Free-DC 10855 s5 1fzeC
4 ? 36,79 1 Marie Suchard - 11049 s1 1fzeC
5 ? 33,49 2 Bletchley Park Cont. 11042 s2 1fzeC

GDT-TS des besten Rosetta-Modells: 82,6 - GDT-TS des besten Servermodells: 94,3 (FAMSD)
GDT-TS of the best Rosetta model: 82.6 - GDT-TS of the best server model: 94.3 (FAMSD)

T0610

F# W# GDT-TS M Spieler (Players) Team Score Sb# Templates
1 ? 61,31 1 Mark- Contenders 12306 s1 1wdjA
2 ? 58,94 5 rmhorton - 11894 s6 1wdjC
3 ? 57,96 4 Commaster Ukraine 11915 s5 1wdjA
4 ? 46,51 2 aap RDF 12096 s3 1wdjA
5 ? 43,85 3 steveB VC 11929 s4 1wdjA

GDT-TS des besten Rosetta-Modells: 72,8 - GDT-TS des besten Servermodells: 72,8 (BAKER-ROSETTASERVER)
GDT-TS of the best Rosetta model: 72.8 - GDT-TS of the best server model: 72.8 (BAKER-ROSETTASERVER)

T0612

F# W# GDT M Spieler (Players) Team Score Sb# Templates
1 canc. 53,0 2 Dolichwier, TheGUmmer, mat747 VC 10650 e4 2vzsB
2 canc. 51,2 1 vakobo, ice--9, Grom Russian team 10710 e1 2x09B
3 canc. 46,1 3 aap RDF 10597 s3 2vzsA 2vzsB
4 canc. 43,9 5 philcalhoun Free-DC 10450 s29 2x09B
5 canc. 42,9 4 CFC, Bletchley Park Contenders 10591 e8 2x09B

GDT-TS des besten Rosetta-Modells: 58,9 - GDT-TS des besten Servermodells: 63,3 (QUARK)
GDT-TS of the best Rosetta model: 58.9 - GDT-TS of the best server model: 63.3 (QUARK)

T0616

F# W# GDT-TS M Spieler (Players) Team Score Sb# Templates
1 ? 31,06 2 Susanne SETI.Germany 10027 s3 -
2 ? 29,55 1 Mark- Contenders 10070 s1 -
3 ? 29,29 3 phrodu - 9999 s5 -
4 ? 28,54 4 Commaster Ukraine 9990 s6 -
5 ? 28,28 5 Grom, ice--9 Russian team 9985 e6 -

GDT-TS des besten Rosetta-Modells: 33,3 - GDT-TS des besten Servermodells: 37,9 (MULTICOM-REFINE)
GDT-TS of the best Rosetta model: 33.3 - GDT-TS of the best server model: 37.9 (MULTICOM-REFINE)

T0619

F# W# GDT M Spieler (Players) Team Score Sb# Templates
1 ? 81,2 2 setiman, gdnskye RDF 10362 e7 2oxoA
2 ? 65,9 5 Commaster Ukraine 10194 s8 2kd1A
3 ? 63,8 4 Pletsch, Datstandin AD 10320 e9 2kd1A
4 ? 61,4 1 Bletchley Park, Mark-, BootsMcGraw, spvincent, infjamc Contenders 10394 e1 3lysA 1a0pA 2kkpA 2kobA
5 ? 43,4 3 rmhorton - 10352 s2 2kd1A

GDT-TS des besten Rosetta-Modells: 88,9 - GDT-TS des besten Servermodells: 88,9 (BAKER-ROSETTASERVER)
GDT-TS of the best Rosetta model: 88.9 - GDT-TS of the best server model: 88.9 (BAKER-ROSETTASERVER)

T0622

F# W# GDT M Spieler (Players) Team Score Sb# Templates
1 ? 62,0 1 Datstandin, Pletsch AD 11247 e1 2vt3B
2 ? 56,0 3 Dolichwier, TheGUmmer, steveB VC 11071 e8 2vt3B 2dt5A
3 ? 49,8 4 mimi & Mark- Contenders 11001 e10 2dt5A
4 ? 46,9 5 rmhorton - 10895 s6 2dt5A
5 ? 36,0 2 Tamison, aap RDF 11198 e5 2dt5A 2py6A 3kuxA

GDT-TS des besten Rosetta-Modells: 66,2 - GDT-TS des besten Servermodells: 67,2 (Zhang-Server)
GDT-TS of the best Rosetta model: 66.2 - GDT-TS of the best server model: 67.2 (Zhang-Server)

T0624

F# W# GDT M Spieler (Players) Team Score Sb# Templates
1 ? 41,7 2 Jim Fraser Contenders 9522 s34 -
1 ? 41,7 3 heather-1 - 9392 s46 -
3 ? 35,4 4 rav3n_pl BOINC@Poland 9344 s51 -
4 ? 33,3 5 rav3n_pl BOINC@Poland 9296 s51 -
5 ? 30,1 1 CFC Contenders 9687 s1 -

GDT-TS des besten Rosetta-Modells: 43,8 - GDT-TS des besten Servermodells: 52,2 (RaptorX-MSA)
GDT-TS of the best Rosetta model: 43.8 - GDT-TS of the best server model: 52.2 (RaptorX-MSA)


∗) AD = Anthropic Dreams, RDF = Richard Dawkins Foundation, VC = Void Crushers, AHAP = Another Hour Another Point, CFC = CharlieFortsConscience
F# = Foldit-Rang (Foldit rank), W# = Weltweiter Rang (world wide rank), M = Modell#, Sb# = Rang auf Solo- bzw. Evolver-Scoreboard (ranking on solo or evolver scoreboard)

Die GDT-Werte der Foldit-Modelle wurden vom Baker Lab mit gdtmm berechnet, die GDT-TS-Werte der Foldit-Modelle wurden mit Hilfe von TM-score des Zhang Lab berechnet.
Die GDT-TS-Werte der besten Rosetta- und Servermodelle stammen vom Zhang Lab
GDT numbers of Foldit models were calculated by Baker Lab using gdtmm, GDT-TS numbers of Foldit models were calculated via Zhang Lab's TM-score.
GDT-TS numbers of the best Rosetta and server models provided by Zhang Lab

CASP9-Refinement-Puzzles

Nr. Target GDT PDB Bester
Score 		Team Bester
Solo-
score 		Spieler
(Player) 		vom Team Bestes Modell,
Spieler,
Team
R1 TR557 67 2kyy 11026 Contenders 11026 Mark- Contenders 3, Madde, VC
4, Grom, Russian team
R2 TR568 43 3n6y 10439 Contenders 10439 Mark- Contenders 5, steveB, VC
R3 TR569 73 2kyw 10081 Contenders 10081 mimi Contenders
R4 TR576 65 3na2 11111 Contenders 11060 drjr Anthropic Dreams
R5 TR592 75 3nhv 11339 RDF 11336 vertex RDF
R6 TR594 86 3ni8 11473 Contenders 11470 Mark- Contenders
R7 TR606 72 3noh 11159 Contenders 11157 Mark- Contenders
R8 TR614 ~70 11047 Contenders 11047 BootsMcGraw Contenders
R8a TR614 ~70 11042 Contenders 11041 Mark- Contenders
R8b TR614 ~70 11006 Contenders 10997 Mark- Contenders
R9 TR622 67 3nkl 11122 Contenders 11120 Bletchley Park Contenders
R10 TR624 56 3nrl 9824 Anthropic Dreams 9796 Datstandin Anthropic Dreams
R10t TR624 56 3nrl 9809 Void Crushers 9800 steveB Void Crushers

GDT-Resultate (Refinement-Puzzles)

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Click on the target numbers to get to the separate articles with pictures of the various models.

TR557

F# W# GDT-TS M Spieler (Players) Team Score Sb#
1 ? 65,60 3 Madde VC 10955 s2
1 ? 65,60 4 vakobo, Grom Russian team 10896 e14
3 ? 65,40 5 Commaster Ukraine 10882 s4
4 ? 64,20 1 Mark- Contenders 11026 s1
5 ? 63,80 2 Tyggy Too, Pletsch7, Krog AD 10971 e5

GDT-TS des Startmodells: 66,60
GDT-TS of the starting model: 66.60

TR568

F# W# GDT-TS M Spieler (Players) Team Score Sb#
1 ? 56,19* 5 steveB VC 10292 s11
2 ? 55,93 2 Madde VC 10193 s34
3 ? 54,90 1 Mark- Contenders 10439 s1
4 ? 50,52* 3 mimi Contenders 10269 s15
4 ? 50,52* 4 g_b - 10110 s55

∗) Foldit model was run through 1 round of Rosetta idealize and relax

GDT-TS des Startmodells: 54,90
GDT-TS of the starting model: 54.90

CASP9-last-Puzzles

Nr. Target PDB Bester
Score 		Team Bester
Soloscore 		Spieler
(Player) 		vom Team
38 T0552 2l3b 11062 Anthropic Dreams 10919 mimi Contenders
39 T0545 2l3f 11939 Anthropic Dreams 11922 jakyl Anthropic Dreams
40 T0546 canceled 11175 Anthropic Dreams 11123 Pletsch Anthropic Dreams
41 T0577 canceled 10972 Anthropic Dreams 10965 keypad5 Anthropic Dreams
42 T0554 canceled 11349 Team Tornado 11387 tim1079
43 T0583 canceled 12083 Anthropic Dreams 12083 Stardancer Anthropic Dreams
44 T0595 canceled 11105 Anthropic Dreams 11105 prot-bustr Anthropic Dreams

CASP9-Scoreboards

Alle Puzzles

Teams

CASP9-Teamwertung (alle Puzzles)1
Team Punkte Gold Silber Bronze
Contenders 4411 28 13 9
Void Crushers 3346 7 20 13
Richard Dawkins Foundation 3048 13 8 8
Anthropic Dreams 2638 5 9 11
Russian team 1636 1 1 7
Free-DC ↑1 859 1 3 0
SETI.Germany ↓1 853 1 1 2
Ukraine 548 0 1 1
Another Hour Another Point 500 0 0 2
Natural Abilities 303 0 0 0
Skeptics Guide to the Universe 254 0 0 1
BOINC@Poland 227 0 0 0
Oma Gawd 131 0 0 1
Boinc.be 122 0 0 0
Segment is locked 87 0 0 1
There Will Be Cake 49 0 0 0


Solos

CASP9-Solospielerwertung (alle Puzzles)1
Spieler Punkte Gold Silber Bronze Team
Mark- 4974 15 9 8 Contenders
mimi 3798 2 4 1 Contenders
aap 3615 12 6 4 Richard Dawkins Foundation
CharlieFortsConscience 3536 5 3 4 Contenders
steveB 3474 3 5 5 Void Crushers
mat747 3438 0 2 6 Void Crushers
BootsMcGraw 3198 1 2 2 Contenders
Madde 3138 5 6 1 Void Crushers
vertex 3054 2 0 1 Richard Dawkins Foundation
Bletchley Park 3038 1 2 2 Contenders
Grom ↑1 2901 0 0 2 Russian team
Dolichwier ↓1 2854 0 1 0 Void Crushers
Pletsch ↑2 2768 1 1 1 Anthropic Dreams
drjr 2722 1 0 0 Anthropic Dreams
TheGUmmer ↓2 2702 0 0 4 Void Crushers
g_b 2449 0 0 0 -
HillObserver 2384 1 1 2 Void Crushers
spvincent 2285 0 2 0 Contenders
vakobo 2204 0 0 0 Russian team
philcalhoun 2160 0 0 0 Free-DC
infjamc ↑1 2105 0 0 1 Contenders
Jim Fraser ↓1 2039 0 0 1 Contenders
Datstandin ↑1 2004 1 0 0 Anthropic Dreams
Susanne ↓1 1954 1 0 2 SETI.Germany
Brick 1849 0 1 0 Free-DC
dimension9 1778 0 1 0 Anthropic Dreams
tallguy-13088 1600 0 1 0 -
Marie Suchard 1541 1 0 1 -
rmhorton 1484 0 1 2 -
auntdeen 1473 0 1 0 Anthropic Dreams
Commaster 1460 0 1 0 Ukraine
SKSbell 1405 0 0 0 -
Renton 1394 0 1 0 Anthropic Dreams
keypad5 1369 0 2 0 Richard Dawkins Foundation
Coskun ↑2 1319 0 1 1 Richard Dawkins Foundation
Cartoon Villain ↓1 1290 1 1 0 -
pk009 ↓1 1260 0 0 0 SETI.Germany
cadeh_cam111 1071 1 0 0 -
Krog 958 0 0 0 Anthropic Dreams
reed 920 0 0 0 Skeptics Guide to the Universe
Perzik 867 0 0 0 Boinc.be
gdnskye ↑1 770 1 0 0 Richard Dawkins Foundation
mrmookie ↓1 734 0 0 0 -
Ell ↑1 609 0 0 0 Segment is locked
xiando ↓1 594 1 0 0 Oma Gawd
Tyggy Too 543 0 0 0 Anthropic Dreams
Ocire 446 0 0 1 Anthropic Dreams
phrodu 428 0 0 0 -
MellyLam 307 0 0 1 Another Hour Another Point
BikeLoup 249 0 1 0 Another Hour Another Point
Rusty76 227 0 0 1 -
blueglow neu 143 0 0 1 -
Endoplasmic Ridiculus ↓1 113 0 0 1 Anthropic Dreams

¹) Berücksichtigt wurden nur Teams und Solospieler, die in mindestens einem CASP9-Puzzle unter die besten 5 gekommen sind.
There are only teams and solo players on the scoreboards who achieved at least one top5-rank in a CASP9 puzzle.


Standardpuzzles

Teams

CASP9-Teamwertung (Standardpuzzles)2
Team Punkte Gold Silber Bronze
Contenders 3273 18 12 9
Void Crushers 2575 6 16 9
Richard Dawkins Foundation 2437 12 5 7
Anthropic Dreams 1987 4 6 9
Russian team 1064 1 1 3
Free-DC 687 1 2 0
SETI.Germany 653 1 1 1
Ukraine 387 0 0 1
Another Hour Another Point 325 0 0 2
Natural Abilities 256 0 0 0
Skeptics Guide to the Universe 187 0 0 1
Boinc.be 104 0 0 0
Oma Gawd 94 0 0 1
There Will Be Cake 49 0 0 0


Solos

CASP9-Solospielerwertung (Standardpuzzles)2
Spieler Punkte Gold Silber Bronze Team
Mark- 3823 9 9 7 Contenders
aap 2881 12 5 2 Richard Dawkins Foundation
mimi 2812 1 2 0 Contenders
CharlieFortsConscience 2704 5 3 4 Contenders
steveB 2661 2 3 5 Void Crushers
mat747 2475 0 1 3 Void Crushers
BootsMcGraw 2416 0 2 1 Contenders
Madde 2308 5 3 1 Void Crushers
Bletchley Park 2245 0 2 2 Contenders
TheGUmmer 2142 0 0 4 Void Crushers
Dolichwier 2128 0 1 0 Void Crushers
vertex 2069 1 0 1 Richard Dawkins Foundation
Pletsch 2015 1 1 1 Anthropic Dreams
Grom 1988 0 0 1 Russian team
drjr 1908 0 0 0 Anthropic Dreams
HillObserver 1701 1 1 2 Void Crushers
philcalhoun 1562 0 0 0 Free-DC
vakobo 1530 0 0 0 Russian team
infjamc 1509 0 0 1 Contenders
rmhorton 1484 0 1 2 -
spvincent 1410 0 2 0 Contenders
Susanne 1390 1 0 2 SETI.Germany
Datstandin 1319 0 0 0 Anthropic Dreams
keypad5 1307 0 2 0 Richard Dawkins Foundation
dimension9 1298 0 1 0 Anthropic Dreams
Brick 1218 0 0 0 Free-DC
Marie Suchard 1188 1 0 1 -
tallguy-13088 1120 0 1 0 -
Commaster 1118 0 0 0 Ukraine
auntdeen 1073 0 1 0 Anthropic Dreams
cadeh_cam111 1018 1 0 0 -
Cartoon Villain 1003 1 1 0 -
Krog 834 0 0 0 Anthropic Dreams
mrmookie 643 0 0 0 -
Perzik 614 0 0 0 Boinc.be
gdnskye 563 1 0 0 Richard Dawkins Foundation
Ocire 446 0 0 1 Anthropic Dreams
Tyggy Too 376 0 0 0 Anthropic Dreams
MellyLam 307 0 0 1 Another Hour Another Point
xiando 275 1 0 0 Oma Gawd
BikeLoup 249 0 1 0 Another Hour Another Point
phrodu 162 0 0 0 -
Endoplasmic Ridiculus 113 0 0 1 Anthropic Dreams

²) Berücksichtigt wurden nur Teams und Solospieler, die in mindestens einem Puzzle unter die besten 5 gekommen sind. Puzzles 1a-37.
There are only teams and solo players on the scoreboards who achieved at least one top5-rank in a CASP9 standard-puzzle.


Refinement-Puzzles

Teams

CASP9-Teamwertung (Refinement-Puzzles)3
Team Punkte Gold Silber Bronze
Contenders 1138 10 1 0
Void Crushers 771 1 4 4
Anthropic Dreams ↑1 651 1 3 2
Richard Dawkins Foundation ↓1 611 1 3 1
Russian team 572 0 0 4
SETI.Germany 200 0 0 1
Another Hour Another Point ↑2 175 0 0 0
Free-DC 172 0 1 0
Ukraine ↓2 161 0 1 0
BOINC@Poland 107 0 0 0
Segment is locked 87 0 0 1
Skeptics Guide to the Universe 67 0 0 0


Solos

CASP9-Solospielerwertung (Refinement-Puzzles)3
Spieler Punkte Gold Silber Bronze Team
Mark- 1151 6 0 1 Contenders
mimi ↑2 986 1 2 1 Contenders
vertex ↓1 985 1 0 0 Richard Dawkins Foundation
mat747 ↓1 963 0 1 3 Void Crushers
Grom 913 0 0 1 Russian team
spvincent ↑2 875 0 0 0 Contenders
Madde ↓1 830 0 3 0 Void Crushers
drjr ↓1 814 1 0 0 Anthropic Dreams
steveB ↑1 813 1 2 0 Void Crushers
Bletchley Park ↑1 793 1 0 0 Contenders
BootsMcGraw ↓2 782 1 0 1 Contenders
Pletsch ↑1 753 0 0 0 Anthropic Dreams
aap ↓1 734 0 1 2 Richard Dawkins Foundation
Datstandin ↑2 685 1 0 0 Anthropic Dreams
HillObserver neu 683 0 0 0 Void Crushers
g_b ↓2 683 0 0 0 -
Coskun 637 0 1 1 Richard Dawkins Foundation
Brick ↓3 631 0 1 0 Free-DC
SKSbell ↓1 574 0 0 0 -
Jim Fraser ↓1 568 0 0 1 Contenders
Ell ↓1 555 0 0 0 Segment is locked
pk009 ↓1 469 0 0 0 SETI.Germany
Renton ↓1 460 0 1 0 Anthropic Dreams
Commaster ↓1 342 0 1 0 Ukraine
reed ↓1 316 0 0 0 Skeptics Guide to the Universe
phrodu ↓1 266 0 0 0 -
Rusty76 ↓1 227 0 0 1 -
blueglow neu 143 0 0 1 -
mrmookie ↓2 91 0 0 0 -

³) Berücksichtigt wurden nur Teams und Solospieler, die in mindestens einem Puzzle unter die besten 5 gekommen sind. Puzzles R1-R10t.
There are only teams and solo players on the scoreboards who achieved at least one top5-rank in a CASP9 refinement puzzle.

Literatur

bild der wissenschaft Ausgabe: 4/2010, Seite 18 - Formvollendet - Artikel über Proteinstrukturvorhersage und CASP

NZZ am Sonntag vom 19.09.2010, Seite 57 - Die WM der Biologen PDF (0,4 MB)

Quellen

  1. ↑ http://www.predictioncenter.org/news.cgi#15
  2. ↑ http://fold.it/portal/node/165875
  3. ↑ http://fold.it/portal/node/273682
  4. ↑ http://fold.it/portal/node/729520
  5. ↑ http://predictioncenter.org/casp9/index.cgi#timetable
  6. ↑ http://fold.it/portal/node/987474
  7. ↑ http://www.predictioncenter.org/casp9/index.cgi?page=format
  8. ↑ http://fold.it/portal/node/987474
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